Bestie w Ninja Kingdom zwane Oni są jedyną jednostką, którą możemy kontrolować podczas walki. Wskazujemy im kliknięciem myszki miejsce, które mają atakować i tak dopóki nie zginą, albo walka nie zostanie ukończona. Inne jednostki walczą kontrolowane przez system (AI) i nie mamy wpływu na to, gdzie i kiedy pójdą – jedynie na początku podczas ich przyzywania możemy ich uwolnić na wskazanym wcześniej terenie. Jednak musicie zwrócić uwagę, że każda jednostka, każdy typ wojownika ma inny, preferowany cel – to oznacza, że przeciwko innym jednostkom uwalniają większą siłę i są bardziej skuteczni.
Oznaczenia są różne i możemy przeczytać co potrafi dana jednostka w szczegółowym jej opisie. I tak przykładowo Grunts oznacza lepszy atak w starciu bezpośrednim, podczas gdy Assassins woli atakować najbliższy cel, ale z dystansu. Ninja zaś atakuje cele obronne, a Thieves cele surowcowe. Podobnie jak Ninja, nasi Samuraje będą najskuteczniejsi w likwidowaniu struktur obronnych.